No hay registros correctos de la época, sin embargo, por medio de informaciones prestadas por antiguos empleados, ese edificio seria usado como residencia de verano del presidente Getulio Vargas. Algunos años mas tarde, la construcción de otro edificio para ese mismo propósito fue autorizada por el Ministro de la Guerra.

Ese edificio ha sido usado, desde el año de 1995, como oficina central administrativa, ambulatorio medico, almacén de cooperativa, vivienda de empleados e administración.

Entre 1970 y 1988 el edificio ha hospedado el centro de visitantes donde se mostraron ejemplares de la fauna y flora regionales, materiales indígenas y una muestra de fotos de otras unidades..

En 1988 el edificio fue cerrado a visitación y la reforma programada, sin embargo, el centro de visitantes fue usado para muestras itinerantes debido a las condiciones precarias de los ejemplares allá expuestos. En este momento, la parte baja del edificio de Administración posee dos auditorios, uno con capacidad para 60 personas e otro para 40 personas y una sala de una muestra permanente de la primera usina ubicada en el río São João cercano al edificio y una sala par el equipo de Manejo y Conservación, que es responsable por todas las actividades de manejo, inspección, pesquisa y protección de la Unidad, mientras en la parte superior del edificio se ubica la Administración con todas sus oficinas y secciones.